Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHBP21912 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHBP21912 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SDHBP21912 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SDHBP21912 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SDHBP21912 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SDHBP21912 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHBP21912 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHBP21912 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHBP21912 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHBP21912 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHBP21912 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SDHBP21912 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHBP21912 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHBP21912 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHBP21912 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SDHBP21912 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDHBP21912 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SDHBP21912 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SDHBP21912 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SDHBP21912 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHBP21912 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHBP21912 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHBP21912 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SDHBP21912 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHBP21912 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHBP21912 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SDHBP21912 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHBP21912 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHBP21912 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SDHBP21912 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHBP21912 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHBP21912 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SDHBP21912 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHBP21912 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SDHBP21912 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHBP21912 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SDHBP21912 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHBP21912 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHBP21912 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHBP21912 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHBP21912 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SDHBP21912 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHBP21912 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHBP21912 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHBP21912 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHBP21912 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SDHBP21912 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHBP21912 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHBP21912 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SDHBP21912 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHBP21912 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHBP21912 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SDHBP21912 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHBP21912 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SDHBP21912 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SDHBP21912 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHBP21912 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHBP21912 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SDHBP21912 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDHBP21912 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SDHBP21912 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHBP21912 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SDHBP21912 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHBP21912 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SDHBP21912 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHBP21912 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHBP21912 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHBP21912 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHBP21912 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SDHBP21912 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHBP21912 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHBP21912 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHBP21912 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SDHBP21912 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHBP21912 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHBP21912 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHBP21912 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SDHBP21912 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHBP21912 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHBP21912 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHBP21912 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHBP21912 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHBP21912 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SDHBP21912 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHBP21912 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHBP21912 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHBP21912 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHBP21912 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SDHBP21912 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SDHBP21912 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHBP21912 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHBP21912 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SDHBP21912 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SDHBP21912 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHBP21912 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHBP21912 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHBP21912 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHBP21912 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SDHBP21912 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms