Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ERBB3P21860 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.01■■■■□ 3.2
ERBB3P21860 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC35■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.95■■■■□ 3.19
ERBB3P21860 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.9■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ERBB3P21860 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.84■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
ERBB3P21860 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
ERBB3P21860 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.73■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
ERBB3P21860 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.64■■■■□ 3.14
ERBB3P21860 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.63■■■■□ 3.13
ERBB3P21860 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms