Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CXCL3P19876 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CXCL3P19876 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CXCL3P19876 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CXCL3P19876 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCL3P19876 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms