Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD53P19397 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD53P19397 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD53P19397 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD53P19397 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CD53P19397 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD53P19397 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CD53P19397 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CD53P19397 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD53P19397 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD53P19397 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD53P19397 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD53P19397 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CD53P19397 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD53P19397 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD53P19397 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD53P19397 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD53P19397 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CD53P19397 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CD53P19397 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CD53P19397 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD53P19397 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CD53P19397 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD53P19397 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CD53P19397 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD53P19397 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CD53P19397 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CD53P19397 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD53P19397 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD53P19397 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD53P19397 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CD53P19397 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD53P19397 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD53P19397 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD53P19397 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD53P19397 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CD53P19397 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD53P19397 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD53P19397 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD53P19397 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD53P19397 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CD53P19397 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD53P19397 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CD53P19397 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD53P19397 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD53P19397 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD53P19397 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD53P19397 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD53P19397 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD53P19397 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD53P19397 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD53P19397 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD53P19397 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD53P19397 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD53P19397 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD53P19397 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD53P19397 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD53P19397 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD53P19397 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD53P19397 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD53P19397 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD53P19397 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD53P19397 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD53P19397 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD53P19397 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD53P19397 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD53P19397 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD53P19397 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD53P19397 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
CD53P19397 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD53P19397 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CD53P19397 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD53P19397 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD53P19397 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD53P19397 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CD53P19397 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD53P19397 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CD53P19397 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD53P19397 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD53P19397 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD53P19397 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD53P19397 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CD53P19397 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD53P19397 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD53P19397 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD53P19397 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD53P19397 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CD53P19397 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD53P19397 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD53P19397 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD53P19397 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD53P19397 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CD53P19397 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms