Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC30■■■□□ 2.39
XBP1P17861 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
XBP1P17861 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30■■■□□ 2.39
XBP1P17861 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30■■■□□ 2.39
XBP1P17861 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
XBP1P17861 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XBP1P17861 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
XBP1P17861 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
XBP1P17861 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XBP1P17861 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XBP1P17861 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
XBP1P17861 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
XBP1P17861 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
XBP1P17861 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
XBP1P17861 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
XBP1P17861 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XBP1P17861 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
XBP1P17861 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
XBP1P17861 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
XBP1P17861 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
XBP1P17861 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
XBP1P17861 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
XBP1P17861 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.93■■■□□ 2.38
XBP1P17861 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
XBP1P17861 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
XBP1P17861 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
XBP1P17861 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
XBP1P17861 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XBP1P17861 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
XBP1P17861 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XBP1P17861 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
XBP1P17861 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
XBP1P17861 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.37
XBP1P17861 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
XBP1P17861 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
XBP1P17861 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XBP1P17861 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
XBP1P17861 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
XBP1P17861 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
XBP1P17861 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
XBP1P17861 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
XBP1P17861 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
XBP1P17861 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
XBP1P17861 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XBP1P17861 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
XBP1P17861 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
XBP1P17861 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
XBP1P17861 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
XBP1P17861 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
XBP1P17861 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
XBP1P17861 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.84■■■□□ 2.37
XBP1P17861 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
XBP1P17861 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XBP1P17861 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
XBP1P17861 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
XBP1P17861 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
XBP1P17861 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
XBP1P17861 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
XBP1P17861 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
XBP1P17861 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
XBP1P17861 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XBP1P17861 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
XBP1P17861 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
XBP1P17861 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
XBP1P17861 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
XBP1P17861 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
XBP1P17861 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
XBP1P17861 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XBP1P17861 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XBP1P17861 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
XBP1P17861 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
XBP1P17861 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
XBP1P17861 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XBP1P17861 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
XBP1P17861 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
XBP1P17861 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
XBP1P17861 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XBP1P17861 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
XBP1P17861 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
XBP1P17861 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
XBP1P17861 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
XBP1P17861 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
XBP1P17861 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
XBP1P17861 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
XBP1P17861 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
XBP1P17861 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XBP1P17861 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
XBP1P17861 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
XBP1P17861 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
XBP1P17861 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
XBP1P17861 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XBP1P17861 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
XBP1P17861 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XBP1P17861 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XBP1P17861 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
XBP1P17861 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
XBP1P17861 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
XBP1P17861 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
XBP1P17861 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
XBP1P17861 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms