Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAFP15056 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
BRAFP15056 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAFP15056 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BRAFP15056 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAFP15056 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAFP15056 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAFP15056 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAFP15056 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAFP15056 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAFP15056 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BRAFP15056 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BRAFP15056 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRAFP15056 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
BRAFP15056 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRAFP15056 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRAFP15056 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BRAFP15056 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRAFP15056 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRAFP15056 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRAFP15056 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BRAFP15056 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRAFP15056 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRAFP15056 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRAFP15056 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BRAFP15056 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRAFP15056 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BRAFP15056 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRAFP15056 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRAFP15056 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRAFP15056 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRAFP15056 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BRAFP15056 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRAFP15056 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BRAFP15056 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRAFP15056 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
BRAFP15056 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRAFP15056 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRAFP15056 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
BRAFP15056 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRAFP15056 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
BRAFP15056 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
BRAFP15056 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRAFP15056 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRAFP15056 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRAFP15056 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRAFP15056 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRAFP15056 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRAFP15056 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
BRAFP15056 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BRAFP15056 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
BRAFP15056 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRAFP15056 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
BRAFP15056 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRAFP15056 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRAFP15056 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRAFP15056 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRAFP15056 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
BRAFP15056 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRAFP15056 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRAFP15056 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRAFP15056 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRAFP15056 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
BRAFP15056 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRAFP15056 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRAFP15056 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
BRAFP15056 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRAFP15056 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRAFP15056 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRAFP15056 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRAFP15056 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRAFP15056 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
BRAFP15056 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRAFP15056 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRAFP15056 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRAFP15056 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRAFP15056 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRAFP15056 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRAFP15056 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
BRAFP15056 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
BRAFP15056 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
BRAFP15056 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
BRAFP15056 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
BRAFP15056 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRAFP15056 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRAFP15056 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRAFP15056 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRAFP15056 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
BRAFP15056 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAFP15056 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAFP15056 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAFP15056 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
BRAFP15056 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms