Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB1P14653 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HOXB1P14653 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
HOXB1P14653 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HOXB1P14653 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB1P14653 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HOXB1P14653 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms