Protein–RNA interactions for Protein: P14209

CD99, CD99 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD99P14209 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CD99P14209 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CD99P14209 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD99P14209 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD99P14209 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD99P14209 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CD99P14209 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD99P14209 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD99P14209 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD99P14209 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CD99P14209 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD99P14209 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD99P14209 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CD99P14209 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CD99P14209 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CD99P14209 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD99P14209 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD99P14209 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD99P14209 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CD99P14209 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD99P14209 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD99P14209 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD99P14209 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD99P14209 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CD99P14209 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD99P14209 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD99P14209 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CD99P14209 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CD99P14209 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD99P14209 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD99P14209 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CD99P14209 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD99P14209 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD99P14209 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD99P14209 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD99P14209 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD99P14209 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD99P14209 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD99P14209 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD99P14209 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD99P14209 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD99P14209 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD99P14209 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD99P14209 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD99P14209 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD99P14209 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD99P14209 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD99P14209 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD99P14209 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD99P14209 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD99P14209 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD99P14209 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD99P14209 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD99P14209 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD99P14209 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD99P14209 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD99P14209 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD99P14209 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD99P14209 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD99P14209 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CD99P14209 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD99P14209 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD99P14209 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD99P14209 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CD99P14209 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CD99P14209 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD99P14209 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CD99P14209 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD99P14209 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD99P14209 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CD99P14209 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD99P14209 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD99P14209 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD99P14209 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD99P14209 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD99P14209 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CD99P14209 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD99P14209 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD99P14209 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD99P14209 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CD99P14209 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CD99P14209 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD99P14209 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CD99P14209 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD99P14209 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD99P14209 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD99P14209 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD99P14209 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD99P14209 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CD99P14209 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD99P14209 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD99P14209 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD99P14209 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CD99P14209 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CD99P14209 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CD99P14209 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD99P14209 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD99P14209 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD99P14209 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD99P14209 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms