Protein–RNA interactions for Protein: P13646

KRT13, Keratin, type I cytoskeletal 13, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT13P13646 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT13P13646 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT13P13646 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT13P13646 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT13P13646 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT13P13646 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT13P13646 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT13P13646 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT13P13646 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KRT13P13646 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT13P13646 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT13P13646 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT13P13646 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT13P13646 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT13P13646 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT13P13646 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT13P13646 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT13P13646 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT13P13646 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT13P13646 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT13P13646 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT13P13646 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT13P13646 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
KRT13P13646 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KRT13P13646 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT13P13646 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT13P13646 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT13P13646 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT13P13646 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KRT13P13646 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT13P13646 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
KRT13P13646 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT13P13646 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT13P13646 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT13P13646 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT13P13646 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
KRT13P13646 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT13P13646 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
KRT13P13646 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT13P13646 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
KRT13P13646 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
KRT13P13646 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KRT13P13646 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT13P13646 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT13P13646 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KRT13P13646 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT13P13646 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT13P13646 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT13P13646 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT13P13646 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
KRT13P13646 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT13P13646 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT13P13646 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
KRT13P13646 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
KRT13P13646 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT13P13646 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
KRT13P13646 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT13P13646 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT13P13646 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
KRT13P13646 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT13P13646 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT13P13646 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT13P13646 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
KRT13P13646 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KRT13P13646 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
KRT13P13646 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT13P13646 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT13P13646 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
KRT13P13646 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT13P13646 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
KRT13P13646 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT13P13646 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT13P13646 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KRT13P13646 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT13P13646 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT13P13646 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT13P13646 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT13P13646 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
KRT13P13646 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT13P13646 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT13P13646 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
KRT13P13646 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT13P13646 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KRT13P13646 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT13P13646 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT13P13646 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT13P13646 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
KRT13P13646 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT13P13646 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KRT13P13646 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT13P13646 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT13P13646 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT13P13646 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT13P13646 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT13P13646 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
KRT13P13646 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT13P13646 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT13P13646 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT13P13646 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
KRT13P13646 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms