Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GP1BBP13224 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GP1BBP13224 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GP1BBP13224 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
GP1BBP13224 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GP1BBP13224 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms