Protein–RNA interactions for Protein: P12235

SLC25A4, ADP/ATP translocase 1, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A4P12235 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
SLC25A4P12235 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC25A4P12235 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SLC25A4P12235 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SLC25A4P12235 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A4P12235 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SLC25A4P12235 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A4P12235 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A4P12235 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A4P12235 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A4P12235 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A4P12235 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SLC25A4P12235 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A4P12235 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A4P12235 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A4P12235 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A4P12235 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A4P12235 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SLC25A4P12235 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SLC25A4P12235 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A4P12235 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A4P12235 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A4P12235 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A4P12235 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SLC25A4P12235 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A4P12235 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A4P12235 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SLC25A4P12235 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC25A4P12235 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms