Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRBP10828 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRBP10828 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
THRBP10828 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
THRBP10828 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRBP10828 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRBP10828 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
THRBP10828 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRBP10828 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRBP10828 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRBP10828 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
THRBP10828 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
THRBP10828 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRBP10828 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
THRBP10828 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRBP10828 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRBP10828 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
THRBP10828 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
THRBP10828 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRBP10828 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
THRBP10828 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRBP10828 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRBP10828 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
THRBP10828 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
THRBP10828 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRBP10828 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
THRBP10828 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRBP10828 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRBP10828 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRBP10828 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRBP10828 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
THRBP10828 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRBP10828 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
THRBP10828 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRBP10828 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
THRBP10828 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRBP10828 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRBP10828 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
THRBP10828 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRBP10828 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRBP10828 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
THRBP10828 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
THRBP10828 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRBP10828 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRBP10828 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRBP10828 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRBP10828 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
THRBP10828 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
THRBP10828 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRBP10828 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRBP10828 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRBP10828 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRBP10828 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
THRBP10828 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THRBP10828 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
THRBP10828 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRBP10828 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
THRBP10828 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
THRBP10828 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24■■□□□ 1.43
THRBP10828 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRBP10828 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRBP10828 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRBP10828 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRBP10828 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
THRBP10828 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
THRBP10828 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THRBP10828 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THRBP10828 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
THRBP10828 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRBP10828 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRBP10828 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRBP10828 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRBP10828 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
THRBP10828 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
THRBP10828 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
THRBP10828 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRBP10828 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRBP10828 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
THRBP10828 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRBP10828 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRBP10828 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRBP10828 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRBP10828 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
THRBP10828 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
THRBP10828 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms