Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PTPRFP10586 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTPRFP10586 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTPRFP10586 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
PTPRFP10586 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.29■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
PTPRFP10586 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
PTPRFP10586 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.2■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms