Protein–RNA interactions for Protein: P0DP03

IGHV3-30-5, Immunoglobulin heavy variable 3-30-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-30-5P0DP03 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
IGHV3-30-5P0DP03 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IGHV3-30-5P0DP03 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IGHV3-30-5P0DP03 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IGHV3-30-5P0DP03 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms