Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD8

PGA3, Pepsin A-3, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGA3P0DJD8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGA3P0DJD8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGA3P0DJD8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGA3P0DJD8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PGA3P0DJD8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PGA3P0DJD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGA3P0DJD8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGA3P0DJD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PGA3P0DJD8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PGA3P0DJD8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms