Protein–RNA interactions for Protein: P0CG48

UBC, Polyubiquitin-C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBCP0CG48 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UBCP0CG48 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UBCP0CG48 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UBCP0CG48 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UBCP0CG48 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBCP0CG48 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBCP0CG48 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UBCP0CG48 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms