Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CSF3P09919 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3P09919 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3P09919 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3P09919 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CSF3P09919 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3P09919 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CSF3P09919 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CSF3P09919 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3P09919 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3P09919 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3P09919 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CSF3P09919 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3P09919 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3P09919 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3P09919 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CSF3P09919 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF3P09919 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CSF3P09919 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CSF3P09919 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3P09919 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3P09919 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSF3P09919 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3P09919 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3P09919 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
CSF3P09919 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3P09919 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSF3P09919 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3P09919 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3P09919 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF3P09919 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3P09919 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3P09919 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3P09919 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3P09919 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF3P09919 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3P09919 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3P09919 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3P09919 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3P09919 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3P09919 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3P09919 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF3P09919 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3P09919 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3P09919 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3P09919 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF3P09919 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF3P09919 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF3P09919 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF3P09919 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF3P09919 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3P09919 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3P09919 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3P09919 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3P09919 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF3P09919 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3P09919 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3P09919 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3P09919 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF3P09919 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3P09919 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3P09919 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3P09919 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF3P09919 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3P09919 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3P09919 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3P09919 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF3P09919 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF3P09919 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF3P09919 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3P09919 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3P09919 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3P09919 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF3P09919 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3P09919 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF3P09919 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3P09919 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF3P09919 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3P09919 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3P09919 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3P09919 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3P09919 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF3P09919 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3P09919 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3P09919 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3P09919 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3P09919 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3P09919 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3P09919 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF3P09919 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CSF3P09919 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3P09919 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3P09919 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3P09919 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3P09919 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CSF3P09919 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3P09919 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3P09919 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CSF3P09919 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CSF3P09919 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms