Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
HSP90AB1P08238 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
HSP90AB1P08238 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
HSP90AB1P08238 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.18■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
HSP90AB1P08238 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
HSP90AB1P08238 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
HSP90AB1P08238 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.95■■■■□ 3.03
HSP90AB1P08238 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.94■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms