Protein–RNA interactions for Protein: P06454

PTMA, Prothymosin alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTMAP06454 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTMAP06454 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTMAP06454 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTMAP06454 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTMAP06454 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PTMAP06454 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTMAP06454 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTMAP06454 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PTMAP06454 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTMAP06454 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTMAP06454 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PTMAP06454 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTMAP06454 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PTMAP06454 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTMAP06454 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PTMAP06454 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTMAP06454 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PTMAP06454 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTMAP06454 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PTMAP06454 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTMAP06454 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTMAP06454 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PTMAP06454 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTMAP06454 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTMAP06454 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PTMAP06454 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTMAP06454 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PTMAP06454 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PTMAP06454 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTMAP06454 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PTMAP06454 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PTMAP06454 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTMAP06454 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PTMAP06454 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTMAP06454 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTMAP06454 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PTMAP06454 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTMAP06454 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTMAP06454 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTMAP06454 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PTMAP06454 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
PTMAP06454 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PTMAP06454 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTMAP06454 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTMAP06454 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PTMAP06454 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTMAP06454 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PTMAP06454 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTMAP06454 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTMAP06454 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
PTMAP06454 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTMAP06454 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTMAP06454 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PTMAP06454 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
PTMAP06454 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTMAP06454 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTMAP06454 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTMAP06454 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTMAP06454 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PTMAP06454 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTMAP06454 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PTMAP06454 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTMAP06454 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PTMAP06454 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTMAP06454 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PTMAP06454 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PTMAP06454 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTMAP06454 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTMAP06454 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTMAP06454 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PTMAP06454 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PTMAP06454 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PTMAP06454 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PTMAP06454 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTMAP06454 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTMAP06454 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTMAP06454 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTMAP06454 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PTMAP06454 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTMAP06454 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTMAP06454 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PTMAP06454 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTMAP06454 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTMAP06454 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PTMAP06454 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PTMAP06454 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms