Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ESR1P03372 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ESR1P03372 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ESR1P03372 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ESR1P03372 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ESR1P03372 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESR1P03372 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESR1P03372 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESR1P03372 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ESR1P03372 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ESR1P03372 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ESR1P03372 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ESR1P03372 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ESR1P03372 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ESR1P03372 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ESR1P03372 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ESR1P03372 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ESR1P03372 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ESR1P03372 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ESR1P03372 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
ESR1P03372 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ESR1P03372 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESR1P03372 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESR1P03372 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESR1P03372 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ESR1P03372 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ESR1P03372 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ESR1P03372 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ESR1P03372 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ESR1P03372 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ESR1P03372 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ESR1P03372 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ESR1P03372 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ESR1P03372 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ESR1P03372 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESR1P03372 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
ESR1P03372 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESR1P03372 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESR1P03372 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ESR1P03372 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESR1P03372 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESR1P03372 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESR1P03372 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESR1P03372 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ESR1P03372 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ESR1P03372 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ESR1P03372 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ESR1P03372 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ESR1P03372 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ESR1P03372 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ESR1P03372 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ESR1P03372 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ESR1P03372 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ESR1P03372 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ESR1P03372 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ESR1P03372 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ESR1P03372 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ESR1P03372 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ESR1P03372 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESR1P03372 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESR1P03372 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESR1P03372 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESR1P03372 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ESR1P03372 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ESR1P03372 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ESR1P03372 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ESR1P03372 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ESR1P03372 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ESR1P03372 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ESR1P03372 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ESR1P03372 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ESR1P03372 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESR1P03372 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESR1P03372 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ESR1P03372 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESR1P03372 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ESR1P03372 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ESR1P03372 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms