Protein–RNA interactions for Protein: P01568

IFNA21, Interferon alpha-21, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNA21P01568 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IFNA21P01568 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IFNA21P01568 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
IFNA21P01568 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA21P01568 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA21P01568 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA21P01568 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA21P01568 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IFNA21P01568 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA21P01568 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA21P01568 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA21P01568 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA21P01568 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IFNA21P01568 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA21P01568 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IFNA21P01568 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA21P01568 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA21P01568 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IFNA21P01568 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA21P01568 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA21P01568 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA21P01568 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA21P01568 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IFNA21P01568 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA21P01568 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA21P01568 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IFNA21P01568 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
IFNA21P01568 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms