Protein–RNA interactions for Protein: P01011

SERPINA3, Alpha-1-antichymotrypsin, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINA3P01011 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SERPINA3P01011 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SERPINA3P01011 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SERPINA3P01011 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SERPINA3P01011 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SERPINA3P01011 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms