Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNUPNO95149 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SNUPNO95149 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SNUPNO95149 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SNUPNO95149 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SNUPNO95149 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SNUPNO95149 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 414 ms