Protein–RNA interactions for Protein: O94817

ATG12, Ubiquitin-like protein ATG12, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG12O94817 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATG12O94817 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG12O94817 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG12O94817 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG12O94817 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG12O94817 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATG12O94817 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG12O94817 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG12O94817 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG12O94817 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATG12O94817 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG12O94817 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG12O94817 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG12O94817 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATG12O94817 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG12O94817 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATG12O94817 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG12O94817 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG12O94817 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG12O94817 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATG12O94817 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG12O94817 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG12O94817 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATG12O94817 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATG12O94817 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATG12O94817 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG12O94817 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG12O94817 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG12O94817 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG12O94817 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATG12O94817 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG12O94817 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG12O94817 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG12O94817 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATG12O94817 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG12O94817 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG12O94817 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG12O94817 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATG12O94817 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG12O94817 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG12O94817 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG12O94817 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG12O94817 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG12O94817 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATG12O94817 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG12O94817 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG12O94817 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATG12O94817 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG12O94817 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG12O94817 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG12O94817 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATG12O94817 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATG12O94817 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATG12O94817 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG12O94817 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATG12O94817 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATG12O94817 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATG12O94817 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG12O94817 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG12O94817 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG12O94817 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG12O94817 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG12O94817 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATG12O94817 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG12O94817 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATG12O94817 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG12O94817 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATG12O94817 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG12O94817 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG12O94817 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG12O94817 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATG12O94817 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG12O94817 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG12O94817 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG12O94817 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATG12O94817 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATG12O94817 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATG12O94817 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG12O94817 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG12O94817 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG12O94817 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG12O94817 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG12O94817 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATG12O94817 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG12O94817 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG12O94817 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG12O94817 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG12O94817 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATG12O94817 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG12O94817 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATG12O94817 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ATG12O94817 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms