Protein–RNA interactions for Protein: O76094

SRP72, Signal recognition particle subunit SRP72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP72O76094 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP72O76094 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRP72O76094 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP72O76094 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP72O76094 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP72O76094 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP72O76094 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRP72O76094 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRP72O76094 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRP72O76094 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP72O76094 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP72O76094 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP72O76094 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP72O76094 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRP72O76094 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP72O76094 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP72O76094 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP72O76094 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP72O76094 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRP72O76094 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP72O76094 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP72O76094 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP72O76094 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRP72O76094 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRP72O76094 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRP72O76094 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRP72O76094 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRP72O76094 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRP72O76094 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRP72O76094 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRP72O76094 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRP72O76094 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRP72O76094 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRP72O76094 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRP72O76094 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRP72O76094 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRP72O76094 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SRP72O76094 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRP72O76094 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRP72O76094 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRP72O76094 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRP72O76094 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRP72O76094 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRP72O76094 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRP72O76094 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRP72O76094 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRP72O76094 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRP72O76094 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRP72O76094 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRP72O76094 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SRP72O76094 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
SRP72O76094 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRP72O76094 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRP72O76094 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRP72O76094 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SRP72O76094 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SRP72O76094 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SRP72O76094 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SRP72O76094 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SRP72O76094 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP72O76094 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP72O76094 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP72O76094 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP72O76094 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SRP72O76094 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP72O76094 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SRP72O76094 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SRP72O76094 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP72O76094 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SRP72O76094 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SRP72O76094 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP72O76094 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP72O76094 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SRP72O76094 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP72O76094 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP72O76094 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SRP72O76094 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP72O76094 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP72O76094 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRP72O76094 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP72O76094 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP72O76094 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP72O76094 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP72O76094 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SRP72O76094 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP72O76094 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SRP72O76094 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP72O76094 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP72O76094 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP72O76094 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP72O76094 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SRP72O76094 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP72O76094 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SRP72O76094 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP72O76094 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SRP72O76094 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP72O76094 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP72O76094 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SRP72O76094 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SRP72O76094 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms