Protein–RNA interactions for Protein: O75871

CEACAM4, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 4, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM4O75871 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CEACAM4O75871 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CEACAM4O75871 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CEACAM4O75871 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CEACAM4O75871 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CEACAM4O75871 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CEACAM4O75871 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms