Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F6O75461 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F6O75461 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
E2F6O75461 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F6O75461 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F6O75461 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
E2F6O75461 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F6O75461 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F6O75461 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F6O75461 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
E2F6O75461 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F6O75461 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
E2F6O75461 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F6O75461 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F6O75461 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
E2F6O75461 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F6O75461 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F6O75461 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F6O75461 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F6O75461 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
E2F6O75461 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
E2F6O75461 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F6O75461 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
E2F6O75461 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F6O75461 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F6O75461 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
E2F6O75461 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
E2F6O75461 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F6O75461 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F6O75461 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
E2F6O75461 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F6O75461 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F6O75461 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F6O75461 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F6O75461 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F6O75461 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F6O75461 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
E2F6O75461 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F6O75461 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
E2F6O75461 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
E2F6O75461 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F6O75461 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F6O75461 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F6O75461 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F6O75461 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
E2F6O75461 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F6O75461 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F6O75461 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F6O75461 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F6O75461 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F6O75461 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F6O75461 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
E2F6O75461 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F6O75461 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F6O75461 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F6O75461 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
E2F6O75461 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F6O75461 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F6O75461 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F6O75461 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F6O75461 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
E2F6O75461 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
E2F6O75461 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F6O75461 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F6O75461 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F6O75461 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F6O75461 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
E2F6O75461 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
E2F6O75461 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F6O75461 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
E2F6O75461 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24■■□□□ 1.43
E2F6O75461 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F6O75461 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F6O75461 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F6O75461 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
E2F6O75461 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F6O75461 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
E2F6O75461 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F6O75461 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F6O75461 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F6O75461 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
E2F6O75461 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F6O75461 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F6O75461 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
E2F6O75461 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2F6O75461 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
E2F6O75461 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F6O75461 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F6O75461 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F6O75461 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
E2F6O75461 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F6O75461 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F6O75461 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F6O75461 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F6O75461 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F6O75461 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F6O75461 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
E2F6O75461 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F6O75461 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
E2F6O75461 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms