Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP104O60308 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP104O60308 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP104O60308 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP104O60308 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP104O60308 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP104O60308 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP104O60308 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP104O60308 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP104O60308 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP104O60308 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP104O60308 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP104O60308 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP104O60308 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP104O60308 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP104O60308 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP104O60308 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP104O60308 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP104O60308 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP104O60308 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP104O60308 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP104O60308 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP104O60308 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP104O60308 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP104O60308 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP104O60308 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP104O60308 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP104O60308 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP104O60308 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP104O60308 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP104O60308 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP104O60308 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP104O60308 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP104O60308 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP104O60308 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP104O60308 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP104O60308 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP104O60308 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP104O60308 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP104O60308 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP104O60308 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP104O60308 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP104O60308 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP104O60308 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP104O60308 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP104O60308 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP104O60308 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP104O60308 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP104O60308 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP104O60308 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP104O60308 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP104O60308 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP104O60308 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP104O60308 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP104O60308 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP104O60308 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP104O60308 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP104O60308 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP104O60308 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP104O60308 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP104O60308 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP104O60308 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP104O60308 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP104O60308 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP104O60308 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP104O60308 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP104O60308 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP104O60308 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP104O60308 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP104O60308 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP104O60308 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP104O60308 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP104O60308 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP104O60308 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP104O60308 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP104O60308 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP104O60308 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP104O60308 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP104O60308 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP104O60308 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP104O60308 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP104O60308 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CEP104O60308 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP104O60308 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP104O60308 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP104O60308 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP104O60308 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP104O60308 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP104O60308 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CEP104O60308 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP104O60308 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP104O60308 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP104O60308 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP104O60308 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP104O60308 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CEP104O60308 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
CEP104O60308 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP104O60308 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CEP104O60308 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CEP104O60308 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms