Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CREB3O43889 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CREB3O43889 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CREB3O43889 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CREB3O43889 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
CREB3O43889 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3O43889 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3O43889 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3O43889 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3O43889 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CREB3O43889 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CREB3O43889 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CREB3O43889 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3O43889 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CREB3O43889 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CREB3O43889 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3O43889 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CREB3O43889 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CREB3O43889 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3O43889 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3O43889 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3O43889 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CREB3O43889 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3O43889 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3O43889 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3O43889 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CREB3O43889 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3O43889 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3O43889 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3O43889 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3O43889 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3O43889 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CREB3O43889 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3O43889 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3O43889 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3O43889 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3O43889 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3O43889 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CREB3O43889 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3O43889 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3O43889 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CREB3O43889 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3O43889 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3O43889 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3O43889 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3O43889 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CREB3O43889 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3O43889 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3O43889 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3O43889 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CREB3O43889 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CREB3O43889 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CREB3O43889 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3O43889 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CREB3O43889 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3O43889 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3O43889 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CREB3O43889 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CREB3O43889 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3O43889 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CREB3O43889 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3O43889 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3O43889 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CREB3O43889 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3O43889 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CREB3O43889 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CREB3O43889 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CREB3O43889 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3O43889 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CREB3O43889 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CREB3O43889 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CREB3O43889 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3O43889 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3O43889 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3O43889 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3O43889 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CREB3O43889 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREB3O43889 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREB3O43889 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CREB3O43889 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3O43889 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3O43889 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
CREB3O43889 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3O43889 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3O43889 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CREB3O43889 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3O43889 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CREB3O43889 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3O43889 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3O43889 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3O43889 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3O43889 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CREB3O43889 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CREB3O43889 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3O43889 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3O43889 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3O43889 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3O43889 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CREB3O43889 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CREB3O43889 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms