Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRODHO43272 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRODHO43272 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRODHO43272 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRODHO43272 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRODHO43272 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRODHO43272 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRODHO43272 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRODHO43272 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRODHO43272 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRODHO43272 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRODHO43272 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRODHO43272 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRODHO43272 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRODHO43272 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRODHO43272 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRODHO43272 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRODHO43272 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRODHO43272 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRODHO43272 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRODHO43272 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRODHO43272 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRODHO43272 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRODHO43272 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRODHO43272 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRODHO43272 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRODHO43272 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRODHO43272 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRODHO43272 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRODHO43272 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRODHO43272 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRODHO43272 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRODHO43272 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRODHO43272 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRODHO43272 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRODHO43272 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRODHO43272 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRODHO43272 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRODHO43272 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRODHO43272 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRODHO43272 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRODHO43272 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRODHO43272 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRODHO43272 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRODHO43272 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PRODHO43272 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRODHO43272 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRODHO43272 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRODHO43272 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRODHO43272 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRODHO43272 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRODHO43272 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRODHO43272 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRODHO43272 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRODHO43272 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRODHO43272 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRODHO43272 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRODHO43272 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRODHO43272 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PRODHO43272 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRODHO43272 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRODHO43272 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRODHO43272 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRODHO43272 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRODHO43272 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRODHO43272 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRODHO43272 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRODHO43272 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRODHO43272 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRODHO43272 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRODHO43272 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PRODHO43272 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRODHO43272 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRODHO43272 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRODHO43272 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRODHO43272 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRODHO43272 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRODHO43272 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODHO43272 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODHO43272 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODHO43272 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRODHO43272 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODHO43272 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODHO43272 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRODHO43272 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODHO43272 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODHO43272 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODHO43272 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODHO43272 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODHO43272 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRODHO43272 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODHO43272 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODHO43272 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODHO43272 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODHO43272 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODHO43272 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODHO43272 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PRODHO43272 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODHO43272 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PRODHO43272 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms