Protein–RNA interactions for Protein: O43164

PJA2, E3 ubiquitin-protein ligase Praja-2, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PJA2O43164 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PJA2O43164 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PJA2O43164 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PJA2O43164 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PJA2O43164 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PJA2O43164 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PJA2O43164 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PJA2O43164 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PJA2O43164 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PJA2O43164 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PJA2O43164 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PJA2O43164 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PJA2O43164 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PJA2O43164 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PJA2O43164 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PJA2O43164 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PJA2O43164 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA2O43164 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PJA2O43164 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA2O43164 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA2O43164 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA2O43164 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PJA2O43164 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PJA2O43164 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
PJA2O43164 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PJA2O43164 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PJA2O43164 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PJA2O43164 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PJA2O43164 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PJA2O43164 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PJA2O43164 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PJA2O43164 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PJA2O43164 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PJA2O43164 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PJA2O43164 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA2O43164 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA2O43164 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA2O43164 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PJA2O43164 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PJA2O43164 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PJA2O43164 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PJA2O43164 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PJA2O43164 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PJA2O43164 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PJA2O43164 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PJA2O43164 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PJA2O43164 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PJA2O43164 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PJA2O43164 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PJA2O43164 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PJA2O43164 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PJA2O43164 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PJA2O43164 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PJA2O43164 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PJA2O43164 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA2O43164 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA2O43164 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA2O43164 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA2O43164 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA2O43164 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PJA2O43164 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PJA2O43164 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
PJA2O43164 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PJA2O43164 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PJA2O43164 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PJA2O43164 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PJA2O43164 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PJA2O43164 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PJA2O43164 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA2O43164 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA2O43164 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA2O43164 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PJA2O43164 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PJA2O43164 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PJA2O43164 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PJA2O43164 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PJA2O43164 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PJA2O43164 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PJA2O43164 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PJA2O43164 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PJA2O43164 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PJA2O43164 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PJA2O43164 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PJA2O43164 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PJA2O43164 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PJA2O43164 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PJA2O43164 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PJA2O43164 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PJA2O43164 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PJA2O43164 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PJA2O43164 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PJA2O43164 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PJA2O43164 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms