Protein–RNA interactions for Protein: O15270

SPTLC2, Serine palmitoyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTLC2O15270 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPTLC2O15270 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SPTLC2O15270 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SPTLC2O15270 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SPTLC2O15270 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
SPTLC2O15270 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SPTLC2O15270 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
SPTLC2O15270 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms