Protein–RNA interactions for Protein: O15061

SYNM, Synemin, humanhuman

Predictions only

Length 1,565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNMO15061 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SYNMO15061 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
SYNMO15061 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.31■■■■□ 3.72
SYNMO15061 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
SYNMO15061 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
SYNMO15061 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNMO15061 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
SYNMO15061 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYNMO15061 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYNMO15061 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
SYNMO15061 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNMO15061 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNMO15061 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNMO15061 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC38.26■■■■□ 3.72
SYNMO15061 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.71
SYNMO15061 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
SYNMO15061 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNMO15061 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
SYNMO15061 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNMO15061 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNMO15061 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.23■■■■□ 3.71
SYNMO15061 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SYNMO15061 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
SYNMO15061 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SYNMO15061 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
SYNMO15061 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNMO15061 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNMO15061 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNMO15061 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNMO15061 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNMO15061 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
SYNMO15061 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNMO15061 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SYNMO15061 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SYNMO15061 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
SYNMO15061 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNMO15061 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNMO15061 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNMO15061 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNMO15061 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
SYNMO15061 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYNMO15061 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
SYNMO15061 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.7
SYNMO15061 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYNMO15061 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
SYNMO15061 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
SYNMO15061 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC38.1■■■■□ 3.69
SYNMO15061 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNMO15061 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
SYNMO15061 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNMO15061 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNMO15061 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC38.08■■■■□ 3.69
SYNMO15061 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
SYNMO15061 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
SYNMO15061 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNMO15061 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
SYNMO15061 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.03■■■■□ 3.68
SYNMO15061 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNMO15061 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNMO15061 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNMO15061 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC38.02■■■■□ 3.68
SYNMO15061 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC38.01■■■■□ 3.67
SYNMO15061 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNMO15061 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNMO15061 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
SYNMO15061 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNMO15061 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNMO15061 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNMO15061 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
SYNMO15061 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNMO15061 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
SYNMO15061 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.94■■■■□ 3.66
SYNMO15061 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC37.93■■■■□ 3.66
SYNMO15061 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNMO15061 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNMO15061 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNMO15061 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
SYNMO15061 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNMO15061 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
SYNMO15061 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNMO15061 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.9■■■■□ 3.66
SYNMO15061 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNMO15061 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNMO15061 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNMO15061 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNMO15061 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNMO15061 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNMO15061 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
SYNMO15061 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC37.88■■■■□ 3.66
SYNMO15061 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYNMO15061 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
SYNMO15061 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
SYNMO15061 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SYNMO15061 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
SYNMO15061 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNMO15061 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.85■■■■□ 3.65
SYNMO15061 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNMO15061 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.84■■■■□ 3.65
SYNMO15061 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
SYNMO15061 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms