Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
J3QRK9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QRK9 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
J3QRK9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
J3QRK9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QRK9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QRK9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QRK9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
J3QRK9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QRK9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QRK9 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QRK9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QRK9 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
J3QRK9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3QRK9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
J3QRK9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QRK9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QRK9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
J3QRK9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
J3QRK9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QRK9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
J3QRK9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QRK9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QRK9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QRK9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
J3QRK9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QRK9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QRK9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
J3QRK9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
J3QRK9 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QRK9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QRK9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QRK9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QRK9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QRK9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QRK9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
J3QRK9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3QRK9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3QRK9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
J3QRK9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QRK9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QRK9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QRK9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QRK9 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QRK9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QRK9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
J3QRK9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3QRK9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3QRK9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
J3QRK9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
J3QRK9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
J3QRK9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3QRK9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3QRK9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3QRK9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
J3QRK9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QRK9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QRK9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QRK9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QRK9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
J3QRK9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRK9 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRK9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRK9 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
J3QRK9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QRK9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
J3QRK9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRK9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRK9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRK9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRK9 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
J3QRK9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QRK9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QRK9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
J3QRK9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRK9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRK9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRK9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRK9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
J3QRK9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3QRK9 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
J3QRK9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
J3QRK9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23■■□□□ 1.27
J3QRK9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRK9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRK9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
J3QRK9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QRK9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
J3QRK9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QRK9 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QRK9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
J3QRK9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QRK9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
J3QRK9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QRK9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QRK9 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
J3QRK9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QRK9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
J3QRK9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
J3QRK9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms