Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
GOLGA8SH3BPF8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GOLGA8SH3BPF8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
GOLGA8SH3BPF8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA8SH3BPF8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA8SH3BPF8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA8SH3BPF8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms