Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NPIPB9F8W1W9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NPIPB9F8W1W9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
NPIPB9F8W1W9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NPIPB9F8W1W9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NPIPB9F8W1W9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NPIPB9F8W1W9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms