Protein–RNA interactions for Protein: F5H4B4

FAM227A, Protein FAM227A, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM227AF5H4B4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FAM227AF5H4B4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
FAM227AF5H4B4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM227AF5H4B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM227AF5H4B4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM227AF5H4B4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM227AF5H4B4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms