Protein–RNA interactions for Protein: A8K0R7

ZNF839, Zinc finger protein 839, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF839A8K0R7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF839A8K0R7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF839A8K0R7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF839A8K0R7 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZNF839A8K0R7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF839A8K0R7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms