Protein–RNA interactions for Protein: A6NI56

CCDC154, Coiled-coil domain-containing protein 154, humanhuman

Predictions only

Length 674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC154A6NI56 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
CCDC154A6NI56 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC154A6NI56 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CCDC154A6NI56 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC154A6NI56 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms