Protein–RNA interactions for Protein: A6NFE2

SMCO2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO2A6NFE2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SMCO2A6NFE2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SMCO2A6NFE2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SMCO2A6NFE2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
SMCO2A6NFE2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SMCO2A6NFE2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SMCO2A6NFE2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMCO2A6NFE2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMCO2A6NFE2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMCO2A6NFE2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SMCO2A6NFE2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMCO2A6NFE2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SMCO2A6NFE2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms