Protein–RNA interactions for Protein: A6NDN3

GOLGA6B, Golgin subfamily A member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6BA6NDN3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
GOLGA6BA6NDN3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
GOLGA6BA6NDN3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GOLGA6BA6NDN3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GOLGA6BA6NDN3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GOLGA6BA6NDN3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GOLGA6BA6NDN3 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GOLGA6BA6NDN3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms