Protein–RNA interactions for Protein: A2RUS2

DENND3, DENN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND3A2RUS2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
DENND3A2RUS2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND3A2RUS2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND3A2RUS2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
DENND3A2RUS2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND3A2RUS2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
DENND3A2RUS2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
DENND3A2RUS2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND3A2RUS2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
DENND3A2RUS2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
DENND3A2RUS2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
DENND3A2RUS2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
DENND3A2RUS2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
DENND3A2RUS2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
DENND3A2RUS2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DENND3A2RUS2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DENND3A2RUS2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DENND3A2RUS2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms