Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVX5

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YVX5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
A0A0J9YVX5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
A0A0J9YVX5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
A0A0J9YVX5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
A0A0J9YVX5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
A0A0J9YVX5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
A0A0J9YVX5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms