Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A0MS03

TRBV5-3, T-cell receptor beta variable 5-3 (non-functional) (Fragment), humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRBV5-3A0A0A0MS03 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRBV5-3A0A0A0MS03 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRBV5-3A0A0A0MS03 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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