Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
KLF12Q9Y4X4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
KLF12Q9Y4X4 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.4 ms