Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TNFSF18Q9UNG2 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms