Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GTF2IRD1Q9UHL9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms