Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA4

LAMTOR3, Ragulator complex protein LAMTOR3, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR3Q9UHA4 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
LAMTOR3Q9UHA4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms