Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SERINC1Q9NRX5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SERINC1Q9NRX5 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms