Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNX1

TUFT1, Tuftelin, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFT1Q9NNX1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUFT1Q9NNX1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUFT1Q9NNX1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms